Ingeniería en acuicultura

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http://10.100.20.74:4000/handle/20.500.13077/23

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Browsing Ingeniería en acuicultura by Author "Juan Esteban Barquero-Chanto"

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    Molecular identification of Streptococcus sp. and antibiotic resistance genes present in Tilapia farms (Oreochromis niloticus) from the Northern Pacific region, Costa Rica
    (2021) Karen Oviedo-Bolaños; Jorengeth Abad Rodríguez-Rodríguez; Carolina Sancho-Blanco; Juan Esteban Barquero-Chanto; Nelson Peña-Navarro; Cesar Marcial Escobedo-Bonilla; Rodolfo Umaña-Castro
    Streptococcosis is a bacterial disease in tilapia that produces economic losses, caused mainly by Streptococcus agalactiae and S. iniae. It is treated using oxytetracycline and florfenicol, which when inappropriately used promotes the selection of antibiotic resistance genes (ARGs). The disease has been mainly associated with stress events such as variations in temperature. The aims of the present study were (1) to detect by molecular methods two species of Streptococcus sp. in a tilapia farm, (2) to relate their presence to physicochemical parameters in the culture system, and (3) to detect the presence of ARGs in tilapia tissues and/or ponds. Tilapia grow-out ponds (n = 30) were sampled, collecting 15 individuals per pond. The physicochemical parameters of water were measured in each pond. Per pond, organs such as the liver, spleen, brain, and eyes were collected from each individual. Then, each organ type was pooled with the respective organ of the other individuals, processed for DNA extraction, and used for PCR analyses to determine the presence of S. agalactiae and S. iniae and for the detection of ARGs (tetM, tetO, fexA, and ermB). The correlations between the presence of S. agalactiae and water physicochemical parameters were determined. Sixty percent of the ponds and 46% of the organ pools were positive for S. agalactiae, whereas S. iniae was not detected. The positive samples showed the following resistance genes: tet(O) (29.1%), tet(M) (12.7%), and erm(B) (1.8%). A moderate but significant positive correlation was found between temperature and the presence of S. agalactiae. This work reported the molecular detection of two species of Streptococcus and ARGs, providing information that allows fast and effective control of these pathogens in tilapia farming. In addition, a future complementary study on Streptococcus sp. serotype distribution and antibiotic resistance genes from tilapia cultured in Costa Rica could also contribute to increase the knowledge of S. agalactiae infections in tilapia farming worldwide.
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    Variabilidad genética del pez Lutjanus guttatus (Perciformes: Lutjanidae) mediante el uso de microsatélites en Costa Rica
    (2023) Alejandra Murillo-Rios; Silvia Ramirez-Flores; Juan Esteban Barquero-Chanto; Nelson Peña-Navarro; Ricardo Pérez-Enríquez
    Introducción: El pargo mancha es un pez marino de alto consumo e interés comercial en Costa Rica que está sometido a una fuerte presión pesquera, la cual puede afectar la diversidad genética y generar problemas por depresión endogámica. Objetivo: Evaluar el estado genético de la población de Lutjanus guttatus mediante el uso microsatélites. Métodos: Se recolectaron muestras entre el 2018 y 2019 y se estudiaron 44 individuos de cada una de las localidades del Golfo de Nicoya y Golfo Dulce. Se realizó la extracción de ADN y la amplificación de diez loci con microsatélites mediante PCR, para la determinación del genotipo, análisis de diversidad genética y estructura poblacional. Resultados: Los parámetros de diversidad indican un elevado polimorfismo asociado con un alto número de alelos obtenidos por locus, pero con bajos niveles de heterocigosidad observada en comparación con la esperada (Ho= 0.774 y 0.800 y He= 0.948 y 0.954 para Golfo de Nicoya y Golfo Dulce, respectivamente). No hay evidencia suficiente para decir que las dos poblaciones son distintas (FST= 0.00264, P > 0.05). La desviación del Equilibrio de Hardy-Weinberg indica la posible mezcla de organismos de origen distinto a los del medio silvestre. Conclusiones: L. guttatus tiene niveles altos de diversidad genética, no hay evidencia de diferenciación en subpoblaciones genéticas, lo que en manejo pesquerías se considera una sola población panmíctica. La posible mezcla de individuos de origen distinto al silvestre sugiere la presencia de organismos de un programa de repoblación o de cultivos comerciales en la región. El uso de marcadores genéticos se recomienda para el monitoreo, además, en programas de repoblación y evaluar su efecto.